Hallo Lazy131,
da wird eine der HDDs in den Schlafmodus gegangen sein und jetzt will ein Programm Daten von der Platte lesen, die nicht im Cache stehen. Dann muss die Platte erst anlaufen und das kann locker die 1-2 Sekunden ausmachen. Erst dann können die erforderlichen Daten gelesen werden und danach gehts weiter.
Versuche herauszufinden, in welchen Situationen das passiert, dann kannst du eventuell finden, welche Daten das sind und diese Daten auf eine der SSDs verlagern.
Alternativ kannst du auch der Platte verbieten, in den Schlafmodus zu gehen. Das kannst du über die Energieeinstellungen des PC machen.
Gruß
computerschrat