Das eine ist die Onboard-Grafik (Intel 82945G Graphics Controller), diese wird in der Regel automatisch vom BIOS deaktiviert, sobald eine diskrete Grafikkarte in den PCI oder AGP-Slot eingesteckt wird.
Eventuell kannst du über eine BIOS-Einstellung erreichen, daß nur die Onboard-Grafik verwendet wird. Dann mußt du aber auch deinen Montitor an den anderen VGA-Ausgang anschließen.
Beide Grafikkarten gleichzeitig zu benutzen zum Zweck der Leistungssteigerung ist in dieser Konfiguration nicht möglich, eventuell könntest du an beiden Grafikkarten einen eigenen Monitor betreiben.