Nö, nicht wirklich. Unübersichtlich kann es genau so mit mehreren Partitionen werden.
Bei mehreren durch Windows zu verwaltenden Partitionen wird Windows allerdings langsamer, wobei das aber wohl nur messtechnisch feststellbar sein wird, beim Arbeiten wird man den Unterschied eher nicht merken.
Sicherheit? Nein -> wenn was Böses auf deine Platte schreiben will, kann es das in alle Partitionen. Außer man stellt die Sicherheitseinstellungen entsprechend ein, aber das kann man auch bei einzelnen Ordnern tun. Und komfortabel ist das auch nicht, immer in die Eigenschaften gehen zu müssen, wenn man doch mal dort eine Datei ablegen will.
Ein Festplattencrash ist ein Festplattencrash; egal, ob sich da jetzt mehrere Partitionen drauf befinden.
Das einzige, was m.M.n. Sinn macht, ist, getrennte System- und Datenpartitionen zu haben. Aber das ist ja bei dir nicht der Fall.