Hallo, bei einem Dualboot System wäre etwas schräg, wenn du die Rechner (Systeme) gleichzeitig anwählen könntest oder was willst du damit sagen?
Ich kenne den "Wise Registry Cleaner" nicht, aber es ist wohl ein Tool wie der RegCleaner oder CCleaner.
Die machen zwar die Registry flott, sind aber keine sicherheitsrelevanten Anwendungen.
Früher hat man (die böse Buben) sich damit begnügt und "nur" den MBR zerschossen, aktuell passiert da wesentlich mehr, also nichts für "Wise Cleaner".
Booten kannst du aber mit den beiden normal, keine andere Probleme beim Arbeiten, nur jetzt mit dem LAN/Internet?
Wie ist denn die Ausgabe von
ipconfig /all, wenn du es auf beiden Systemen ausführst?
Sagt was die Ereignisanzeige (beide Systeme) dazu?
Ausführen per: [Win-Taste] + [R] » eventvwr « - da unter "System", "Anwendungen" schauen.
Lasse mal ein Live System laufen, damit dann booten und online gehen.
So kannst du sehen, ob du damit normal ins Netz gehen kannst oder tauchen ebenfalls gleiche Probleme auf.
Entfernen Sie bösartige Software mit dem Windows Malicious Software Removal Tool
Bezüglich deiner Vermutung, hier eine Auswahl an Tools:
Anti-Rootkit
Bei Bedarf findest du im Netz näheren Infos und Anleitungen zu den erwähnten Tools.
Gruß