TrueCrypt-Volumes kannst du wunderbar defragmentieren - dazu müssen sie natürlich vorher gemountet sein. Ein Volume ist ein vollständiges Laufwerk/Partition.
TrueCrypt-Container kannst du ebenfalls defragmentieren, wenn du sie mountest - da auch sie in sich wie ein Dateisystem agieren und deshalb dieselben Eigenschaften haben.
Ein Laufwerk/Partition, welches TrueCrypt-Container enthält zu defragmentieren wird jedoch nicht empfohlen, da dies ein Sicherheitsrisiko darstellt:
www.truecrypt.org/docs/?s=defragmenting.
"Sicher löschen" ist in jedem Fall unnötig, da die Daten ohnehin verschlüsselt sind - das wäre definitiv vergeudete Rechenzeit.
Das GMX MediaCenter scheint WebDAV zu benutzen - das ist ungefähr wie ein Netzlaufwerk. Die Defragmentierung funktioniert nur für lokale Datenträger, wohingegen der Datenträger deiner "Verbindung" woanders ist. Dort wird mit an Sicherheit grenzender Wahrscheinlichkeit auch ein Dateisystem verwendet, welches nicht so schnell fragmentiert.