Hi,
hast du die Datenträgerprüfung mal vollständig durchlaufen lassen? Wurden irgendwelche Fehler angezeigt? Ansonsten kannst du mal, wenn der Rechner läuft, "CHKDSK C: /P /R" eingeben. Es kann aber auch sein, dass sich ein Virus eingenistet hat. In so einem Fall wäre es am einfachsten den Scan deines Antivirenprogrammes durchzuführen. Oder Versuche, den besagten Ordner mittels ubuntu-Life-CD zu löschen.
mfg