Hi Bratpfanne,
mir ist keine Schadsoftware bekannt die man per lowlevel Format eher beseitigen würde als ohne.
Ein einfaches Format der Platte reicht falls du dir kein Rootkit eingefangen hast.
Wenn du dir unsicher bist dann kannst du mit einer Linux Live CD mal alles mit dem Befehl dd mit Nullen oder Einsen überschreiben (Bootsektor gleich mit) danach ist die Platte sicher sauber.
Gruß Fabian