Hallo,
verstehe ich es richtig, du hast zwei Betriebssysteme auf dem Rechner und startest über den Bootmanager eines der beiden?
Mit dem Löschen der Verzeichnisse Windows und Programme würdest du dir ja im laufenden System den Ast absägen, auf dem das Betriebssystem sitzt. Das lässt Windows vernünftigerweise nicht zu.
Du kannst über WIN+r -> msconfig -> Start den Eintrag für das "falsche" Windows löschen. Starte neu um den richtigen Eintrag zu testen.
Dann gehe in die Datenträgerverwaltung suche die Partition mit dem nicht gebracuhten Windows und lösche sie. Dann kannst du die Partition neu erstellen, formatieren und wieder als Speicherplatz verwenden.
Grundsätzlich solltest du vor solchen Aktivitäten immer eine Sicherung aller wichtigen Daten anlegen, damit im Fehlerfall nichts verloren geht.
Gruß
computerschrat