Hallo,
chkdsk der Systempartition kann grundsätzlich nur dann ausgeführt werden, wenn das System selbst nicht läuft. Deshalb muss bei einer entsprechenden Rückfrage bestätigt werden, dass chkdsk in dem Fall erst vor dem nächsten Systemstart auszuführen ist. Der entsprechende Hinweis ist also OK.
Chkdsk /f prüft nur das Dateisystem und korrigiert eventuelle Fahler darin. Das bringt aber nichts, wenn ein paar Sektoren, auf die das Dateisystem als Speicherort von bestimmten Daten verweist, fehlerhaft sind. Mit dem Befehl chkdsk /r werden sowohl ggf. vorhandene Fehler des Dateisystems repariert, als auch, sofern möglich, die Inhalte fehlerhafter Sektoren in Reserve-Sektoren der Festplatte geschrieben und die Verweise im Dateisystem entsprechend angepasst.
Gruß
Kalle