Den Sinn verstehe ich auch nicht.
Die Ursache deines Problems ist aber wahrscheinlich, dass die
Einträge nicht nur in HKEY_CLASSES_ROOT vorhanden sind, sondern
auch in HKEY_LOCAL_MACHINE.
Beim Zurückführen hast du wahrscheinlich nur die "Ordner" neu
angelegt. Damit der alte Zustand wiederhergestellt wird, müssen aber
auch die dazugehörigen Werte Eingetragen werden.
Gruß Flupo