Hallo,
ich vermute mal dass du den Dateityp .lnk einem bestimmten Programm zugewiesen hast und deshalb immer dann wenn du auf eine Verknüpfung klickst dieses Programm geöffnet wird. Da aber die meisten Desktop-Icons und auch die Einträge in der Programmauswahl nur Verknüpfungen sind, sieht es dann so aus als, als hättest du EXE-Dateien mit einem anderen Programm verknüpft.
Wenn ich mit meiner Vermutung richtig liege müssten im Explorer für alle Dateien immer noch die korrekten Programm-Icons angezeigt und z.B. per Doppelklick auf eine *.doc müsste dann auch korrekt die Winword.exe (Word) gestartet werden.
In dem Fall sehe ich zwei Möglichkeiten:
In der Registry die Einträge zur .lnk löschen und die korrekten Schlüssel und Werte wieder einlesen lassen
oder
Unter C:/ Windows / System32 einen Doppelklick auf die rstrui.exe ausführen, um die Systemwiederherstellung direkt zu starten.
Gruß
Kalle