Hallo Sascha,
wo sind die PDFs dann gespeichert, im festgelegten Downloadverzeichnis?
Und gib mal in der Adresszeile von Chrome [b]about:plugins[/b] ein, das ist der kürzeste Weg zu diesen Einstellungen. Dort sieh mal nach, ob der Adobe Reader noch aufgeführt und dann aber der Eintrag ausgegraut ist.
Du könntest auch mal den Eintrag Chrome PDF Viewer 'Deaktivieren', anschließend Versuchen eine PDF zu öffnen und den Viewer wieder 'Aktivieren'. Manchmal bewirken auch solche Änderungen an den Einstellungen schon was.
Gruß
Kalle