Ich kenne zwar die Software Display Fusion nicht, kenne aber den beobachteten Effekt.
Folgendes hilft mir:
Ein Fenster des betreffenden Programms (auch bei mir sind eigentlich nur Firefox und Thunderbird betroffen) in den Fenstermodus versetzen (wichtig!), auf den richtigen Monitor schieben und hier, immernoch als Fenster, nicht maximieren, schließen.
Spätestens nach der zweiten oder dritten Wiederholung dieses Zyklus startet das Programm wieder auf dem richtigen Bildschirm.
Das kommt übrigens dadurch, dass sich die Programme merken, wo sie das letzte mal offen waren. Daher vermeide ich, wenn möglich, das Schließen von Fenstern auf meinem 2. Bildschirm, der auch bei mir häufig aus ist.
Ele