Ich hab die Frage auch nicht verstanden. Am meisten Sinn ergibt die Verwaltung der Lesezeichen/Favoriten im Benutzerprofil statt im Browser. Da landen dann die Links als einzelne Verknüpfungen.
Wenn man das braucht, kann man sich (zumindest bei Chrome und Firefox) damit behelfen, dass man die Lesezeichen-Verwaltung öffnet (Strg+Umschalt+O) und die gewünschten Links per drag-and-drop in den Zielordner zieht.
Eventuell lohnt auch die Suche nach einem passenden AddOn.
Gruß Flupo