Auch Knoppix kennt FAT32. Alle Betriebssysteme, die nach 1990 erschienen sind, kennen FAT32. Es hat nie eine Koppix-Version gegeben, die FAT32 nicht kannte. FAT32 gibt es seit 1986 und es wurde sehr schnell zum Standard, und ist bis heute der Grund-Standard. ExFAT ist zwar, nicht ohne Grund, deutlich beliebter, kann aber aus lizensrechtlichen Gründen kein Standard werden. Auch VFAT, das in FAT32 normalerweise enthalten ist, kennen alle Koppix-Version.
NTFS ist das Standardformat unter Windows NT ab Version 3.0, unter Windows 2000 ab SP2, unter VISTA und allen nachfolgenden Versionen. Deine Festplatten sind wahrscheinlich nicht mit FAT32formatiert. Wenn Windows installierst, wird die Platte dabei immer neu formatiert. In der Standardinstallation normalerweise mit NTFS.