Wenn du die Systempartition auf eine SATA-Platte überspielen willst, mußt du auf jeden Fall vorher die entsprechenden SATA-Treiber installieren, da es sonst zum berüchtigten "INACCESSIBLE BOOT DEVICE" Bluescreen kommt.
Wenn zumindest eine der beiden Platten von Seagate stammt, kannst du mit dem Seagate DiscWizard(?) ebenfalls die Partitionen verschieben, wobei diese sogar in der Größe verändert werden können.