Hallo,
diese Art Adapter sind 'Stand Alone'-Lösungen, da sie selbst sich nicht auf MS, SL oder CS jumpern lassen und die Platten bekanntermaßen auch nicht. An einem IDE-Port (Kabel) darf deshalb nur jeweils ein Gerät betrieben werden, auch in Kombination mit einem gejumperten IDE-Laufwerk am selben Kabel ist i.d.R. kein stabiler Betrieb möglich.
Ich würde die Systemplatte mit dem Bootsektor allein per Adapter an einem IDE-Kabel betreiben und die zweite Platte über eine PCI-SATA-Schnittstellenkarte einbinden. Die gibt es auch für PCI Express und mit mehreren SATA -Ports, ggf. noch umschaltbar zwischen intern (SATA) und extern (eSATA). Je nach dem was du für Steckplätze frei hast und wie du den künftigen Bedarf an SATA-Ports einschätzt.
Gruß
Kalle