Warum die Übertragungsraten nach Lagerung sinken, weiß ich auch nicht.
Wenn das mit exFAT nicht auftritt, würde ich dieses Format nutzen.
Dass das als Standard hinterlegt ist, hängt vielleicht damit zusammen, dass z.B. Android NTFS (standardmäßig) nicht kann und die Sticks universell nutzbar sein sollen. Das ist aber nur eine Vermutung.
Gruß Flupo