Die Beschreibung des Fehlers deutet für mich darauf hin, dass nach dem Start eine Aktion ausgeführt wird, nach deren Beendigung es dann erst mit den anderen Programmen weitergeht.
Ich würde versuchen, während der Wartezeit den TaskManager zu öffnen (STRG+Alt+Entf. und dann im Menü auswählen), um da mal zu schauen, welcher Prozess gerade für CPU und/oder Datenträger-Auslastung sorgt. Ein Klick auf die entsprechende Spalte sortiert die Liste danach.
Sollte das nicht klappen, kann man sich auch durch die Windows-Protokolle in der Computerverwaltung wühlen und schauen, ob es da irgendwelche Fehlermeldungen mit passendem Zeitstempel gibt.
Gruß Flupo